Δύο από τους σημαντικότερους τάφους της πορτογαλικής ιστορίας βρίσκονται στο προστώο της εκκλησίας, εκατέρωθεν της δυτικής εισόδου. Στα αριστερά βρίσκεται ο Vasco da Gama, ο θαλασσοπόρος του οποίου το ταξίδι στην Ινδία το 1497–99 άνοιξε τον θαλάσσιο δρόμο της Ευρώπης προς την Ασία και έκανε την Πορτογαλία, για λίγο, το πλουσιότερο στέμμα της Ευρώπης. Πέθανε στο Κοτσίν το 1524· τα λείψανά του επαναπατρίστηκαν στην Πορτογαλία σταδιακά και τελικά εναποτέθηκαν στους Ιερωνύμους το 1898 με αφορμή τα 400 χρόνια από το ταξίδι. Στα δεξιά, σε έναν αντίστοιχο τάφο που τοποθετήθηκε την ίδια εποχή, βρίσκεται ο Luís Vaz de Camões — ο ποιητής των Os Lusíadas (1572), του εθνικού έπους που μετέτρεψε το ταξίδι του Vasco da Gama σε ομηρική αφήγηση. Ο ίδιος ο Camões δεν έπλευσε ποτέ στην Ινδία με οποιαδήποτε τεκμηριωμένη ιδιότητα, αν και πέρασε χρόνια στο Μακάο και την Ανατολική Αφρική και έχασε το ένα του μάτι πολεμώντας στο Μαρόκο.
Πέρα από τους τάφους του προστώου, η εκκλησία φιλοξενεί τους βασιλικούς τάφους της δυναστείας Avis-Beja στο ιερό και τα εγκάρσια κλίτη: τον Μανουήλ Α΄ (τον ιδρυτή), τη σύζυγό του Μαρία της Αραγονίας, τον Σεβαστιανό Α΄ και τον Καρδινάλιο-Βασιλιά Ερρίκο. Ο τάφος του Μανουήλ Α΄ βρίσκεται σε μια γρανιτένια κόγχη στα δεξιά του υψηλού βωμού. Η γραμμή Avis-Beja έληξε με τον θάνατο του Καρδινάλιου-Βασιλιά Ερρίκου το 1580, μετά τον οποίο η Πορτογαλία εισήλθε σε μια προσωπική ένωση 60 ετών με την Ισπανία των Αψβούργων — μια περίοδο κατά την οποία οι Ιερώνυμοι συνέχισαν να λειτουργούν ως ενεργό μοναστήρι.
Ο Fernando Pessoa — ο πιο πολυμεταφρασμένος διεθνώς Πορτογάλος ποιητής του 20ού αιώνα — επανατάφηκε στο κάτω κλίτρο του Mosteiro dos Jerónimos το 1985, πενήντα χρόνια μετά τον θάνατό του, ως αναγνώριση της θέσης του ως του μοντερνιστικού λογοτεχνικού γίγαντα της χώρας. Ο τάφος του, σχεδιασμένος από τον γλύπτη Lagoa Henriques, βρίσκεται στη βόρεια πτέρυγα του κάτω κλίτρου και είναι ένα από τα πιο επισκέψιμα σημεία του συγκροτήματος. Οι τάφοι του Μανουήλ Α΄ και των βασιλέων της δυναστείας Avis-Beja στο ιερό της εκκλησίας είναι ορατοί από τον κεντρικό ναό αλλά δεν μπορείτε να τους πλησιάσετε· οι επισκέπτες στέκονται στο κιγκλίδωμα του ιερού. Οι τάφοι του Vasco da Gama και του Camões στο προστώο της εκκλησίας είναι οι μόνοι δίπλα στους οποίους μπορείτε να σταθείτε ακριβώς. Η επανεγκατάσταση αυτών των δύο τάφων τον 19ο αιώνα σε αντίστοιχα νεο-μανουελίνικα κιβώρια ήταν μια σκόπιμη χειρονομία εθνικής μυθοπλασίας από το κράτος της ύστερης μοναρχίας.